根据句子结构和上下文，最合适的词应该是“vessels”（船只）。所以完整的句子应该是： “We are advised by the shipping company that because direct vessels sailing for your port...” 这句话的意思是：“航运公司通知我们，由于直接驶往你方港口的船只……” 这里，“vessels”指的是用于海上运输的船只，与“sailing for your port”相符，表示这些船只是直接前往指定的港口的。而“boats”通常指较小的船只，“buses”是陆地交通工具，“flights”则是航班，都与“sailing”这一航海行为不相符。因此，“vessels”是最合适的选择。
