在地下矿山通风系统中，识别哪些情况构成重大隐患是至关重要的，因为这直接关系到矿山的安全生产和作业人员的生命健康。针对给出的选项，我们可以逐一分析： A. **采用自然通风**： 自然通风在地下矿山中通常不是可行的选择，因为它无法保证矿井内空气质量符合安全标准，也无法有效控制风流方向和速度。特别是在复杂或深部的地下矿山，自然通风几乎无法满足需求。因此，采用自然通风很可能导致矿井内空气质量恶化，有害气体积聚，构成重大安全隐患。此选项符合重大隐患的判定。 B. **主通风机的备用电机不在风机房或硐室内**： 虽然备用电机的位置对于快速切换和应急响应有一定影响，但通常不直接构成重大隐患。关键在于备用电机是否能在需要时迅速启用，并且其性能和原电机相当。因此，此选项不完全符合重大隐患的定义。 C. **主通风机进行了整机备用，但是未另外单独备用电机**： 整机备用提供了一种应急手段，即使未单独备用电机，只要备用整机能够在主通风机故障时迅速投入运行，就不一定构成重大隐患。然而，如果备用整机的维护和测试不足以保证其即时可用性，则可能构成隐患，但不一定是重大隐患。 D. **未设在线监测系统，通风系统检测周期超过1年**： 缺乏在线监测系统会增加对通风系统状态监控的难度，但检测周期超过1年本身并不直接构成重大隐患，除非这种检测周期的延长导致了明显的安全隐患或事故。关键在于是否有其他有效的监控和检测手段来确保通风系统的正常运行。 E. **发生火灾到实现反风时间为15min，主通风机控制人员接到指令到反风时间为gmin**（注意：此选项中“gmin”为未知时间，无法直接评估）： 反风时间的长短对于火灾等紧急情况的应对至关重要。然而，仅凭“15min”的火灾到反风时间和未知的“gmin”控制人员响应时间，无法直接判断其是否构成重大隐患。如果“gmin”非常长，以至于严重影响了反风措施的及时实施，那么可能构成重大隐患。但由于具体时间未知，此选项无法直接判定。 综上所述，**选项A（采用自然通风）**明确且直接地构成地下矿山通风系统的重大隐患。 因此，答案是A。
